据1986年的调查及访问了解，当时种群尚有350只左右，如今不仅数量未增长，反而急剧下降，可以认为本种是当今世界上有蹄类中最濒危的一个种。其致危原因是人类活动的严重影响，表现在：
1、1949-1987年间，青海湖周围人口已由过去的2万增加到9万，因而房舍不断兴建及耕地面积不断扩大（增加了20倍），致使普氏原羚的生存空间愈来愈小，栖息生境支离破碎；
2、 自1949年至今，湖周地区的牲口增加了3倍，占据了普氏原羚的食物场，食物压力增大；
3、 现有种群的群体过小，且由于人为所造成的阻碍，使湖东与湖西间的种群彼此隔离，不能进行基因交流。因此，近亲繁殖的结果，也很可能导致种群衰退；
4、自1988年划为国家I级保护动物后，年近间仍有非法猎杀发生。如1994年12月，在共和县倒淌河乡有人用半自动步枪猎捕普氏原羚（数量不详）；且将草场引燃，烧毁草场面积约1000亩。
