青藏高原是地球上隆起较晚、海拔最高的高原，素有世界“第三极”之称，是中国和东南亚地区巨河大川的发源地，也是世界山地生物物种的一个重要起源和分化中心，生态环境原始、独特而又十分脆弱。线路所经多为高原草甸地区，受严酷的气候条件影响，青藏高原的植被生长非常缓慢，一旦遭到破坏就很难恢复。青藏铁路在设计时就注意尽量减少对生态的影响。在自然保护区内，铁路线路遵循“能避绕就避绕”的原则进行规划。在对野生动物的生活规律、迁徙方向进行研究后，确定了青藏铁路野生动物的通道和数量。铁路施工场地、便道、砂石料场的选址都经过反复踏勘确定，尽量避免破坏植被。对植被难以生长的地段，在施工时采取逐段移植的方法，对自然条件稍好的地段，进行人工草皮培植。施工中积极开展植被恢复技术研究，严格控制工程破土面积，有效保存地表植被和表土。在沿线沱沱河、安多及当雄等不同环境条件下，开展了高寒草原、高寒草甸植被恢复与再造试验研究，为沿线生态植被恢复工作提供了科学依据和有效指导，为生态系统的重构和再生奠定了基础。
